马来西亚理科大学建筑学硕士课程为期两年，是建筑学理科学士学位的延续，或来自其他本地大学或国外具有LAM第一部分认证或同等学历的类似学位。除了培养未来的建筑师，使其能够胜任探索设计过程和相关技能，马来西亚理科大学建筑学硕士课程还为学生提供了机会，让他们对当代问题，如可持续性、特殊技术、保护或其他特殊兴趣领域进行专门研究。第一年的目标是让学生接触多层建筑的设计，重点关注技术和绿色方面，而第二学期则针对住房问题、经济适用房的问题解决，为人类居住而设计的独特住宅理念。学生还应探索不同类型、场地背景、限制和规模的小型项目。在最后一年，学生将完成一项独立的设计论文研究。马来西亚理科大学该课程在设计上提倡整体绿色方法，结合能源效率、最佳室内环境质量和其他相关绿色标准，培养具有能源意识、前瞻思维和对环境敏感的未来建筑师，为未来的需求提供革命性和创新的解决方案。学生还应在培养强烈的哲学思维的同时，对物理、社会和文化方面保持敏感，同时应对一系列当代问题和风格。进入该课程的先决条件是在完成建筑学学士（第一部分）后，在相关建筑领域至少有6个月的工作经验。